Die Einbeziehung der Manuellen Strukturanalyse führt zu gewebespezifischen Diagnosen.
Bei der Manuellen Strukturanalyse werden die Strukturen der Kiefergelenke untersucht und eine Verdachtsdiagnose gestellt. Dazu gehören die Gelenkflächen und der Bandapparat des Kiefergelenkes. Knackgeräusche werden in ligamentäre (Bandapparat) und diskusbedingte (Bandscheibe des Kiefergelenkes) Geräusche differenziert. Isometrische Muskeltest der Kiefermuskeln ergänzen die Untersuchung.